１９８２年（昭和５７年）中部地区教員養成校の音楽担当者への呼びかけにより９大学１４名の教員が集まり「ピアノメソード」の編集が始まり、「カレッジピアノ研究会」（その後、中部地区大学音楽教育学会）として会が発足。
関東地区においても、同時期に「ピアノマーチアルバム」を編集し、名称を「関東地区大学音楽研究協議会」（その後、関東地区大学音楽教育学会）として会が発足した。
その後、関西地区においても「カレッジピアノ研究会」（その後、関西地区大学音楽教育学会）、中・四国地区「中・四国大学音楽教育学会」、九州地区「九州地区大学音楽教育学会」の順に発足した。
１９８４年（昭和５９年）に「全国大学音楽教育学会」と改名し、この学会が全国組織になった。また、１９８７年（昭和６２年）に東北地区（東北地区大学幼年音楽教育学会）、１９８９年（平成元年）に北海道地区（北海道地区大学音楽教育学会）が加わり、全国７地区の研究会が全国的に統合された。
各地区においては、それぞれ地区の特色を生かし、研究会を年１回ないし２回行い、全国大会は、年１回各地持ち回りとした。
２００３年（平成１５年）各地区の名称を全国大学音楽教育学会〇〇地区と統一、また、英語名称を NATIONAL ASSOCIATION OF COLLEGE MUSIC EDUCATION （NACOME）とした。
【過去の全国大会の記録】
●2023年（令和5年）第38回全国大会《東京大会》
（会場：KKRホテル東京・ルーテル市ヶ谷ホール）８/２４〜８/２６
＜大会テーマ＞：これからの子どもの教育と音楽 〜子どもの表現を保育現場と養成校の立場から再考する〜
●2022年（令和4年）第37回全国大会《倉敷大会・オンライン開催》
８/２６
＜大会テーマ＞：乳児期に育てたい非認知能力とは
●2021年（令和3年）第36回全国大会《オンライン開催（大阪大会）》
（配信拠点：大阪キリスト教短期大学）８/２７
＜大会テーマ＞：これからの音楽教育のゆくえ
＊コロナ禍のため、第36回全国大会は１年延期して開催された。
●2019年（令和元年）第35回全国大会《札幌大会》
（ホテル札幌ガーデンパレス）８/２２〜８/２４
＜大会テーマ＞：これからの社会に育ちゆくこどもたち
●2018年（平成30年）第34回全国大会《仙台大会》
（仙台ガーデンパレス）８/２３〜８/２５
＜大会テーマ＞：豊かな感性の育ちから音楽表現へ
●2017年（平成29年）第33回全国大会《岐阜大会》
（ホテルグランベーヴェール岐山、クララザールじゅうろく音楽堂)
８/２４〜８/２６
＜大会テーマ＞：音楽教育、その未来への指針
ー学習指導要領・幼稚園教育要領・保育所指導指針の改訂に向けてー
●2016年（平成28年）第32回全国大会
《鹿児島大会》（鹿児島女子短期大学）８/２６〜８/２８
＜大会テーマ＞：子どもの心をゆり動かす音楽表現
●2015年（平成27年）第31回全国大会《下関大会》
（山口県国際総合センター海峡メッセ下関）８/２７〜８/２９
＜大会テーマ＞：子どもと音と表現
●2014年（平成26年）第30回 全国大会《東京大会》
＜大会テーマ＞：
「子どもの歌 ー唱歌・童謡１４０年のあゆみ」に音楽教育の原点を探る
●2013年（平成25年）第29回 全国大会《大阪大会》
＜大会テーマ＞：音楽教育、その未来への指針 ー伝承音楽と子どもたちー
●2012年（平成24年）第28回 全国大会《旭川大会》
＜大会テーマ＞：いま育ち行くこどもたちの姿
●2011年（平成23年）第27回 全国大会
《東北・裏磐梯大会》
＜大会テーマ＞：豊かな表現の育ちに向けて
●2010（平成22年）第26回 全国大会《名古屋大会》
＜大会テーマ＞：養成校の今日的課題
ー幼・保から小学校まで見渡す音楽教育のあり方を探るー
●2009年（平成21年）第25回 全国大会《佐賀大会》
９/３〜９/４
＜大会テーマ＞：子どもの幸せを求めて
ー保育者を要請する我々の心はどうあるべきかー
●2008年（平成20年）第24回 全国大会《横浜大会》
９/４〜９/６
＜大会テーマ＞：豊かな心を育てる音楽教育をめざして
●2007年（平成19年）第23回 全国大会《倉敷大会》
１０/１１〜１０/１２
＜大会テーマ＞：保育者養成における音楽教育・ー豊かな表現を求めてー
●2006年（平成18年）第22回 全国大会《神戸大会》
８/３１〜９/２
＜大会テーマ＞：音楽教育と人間形成・ー子どもの心を育てる音楽教育とはー
●2005年（平成17年）第21回 全国大会《札幌大会》
９/１〜９/３
＜大会テーマ＞：保育者養成の今日的課題と質的向上
●2004年（平成16年）第20回 全国大会
《東北・松島大会》９/３〜９/４
＜大会テーマ＞：今世紀の保育者養成を考える・ー音楽の本質と子どもの育みをみつめてー
●2003年（平成15年）第19回 全国大会
《中部地区大会》９/４〜９/６
＜大会テーマ＞：「自ら学ぶ学生」をめざして・ー音楽教育の視点からー
●2002年（平成14年）第18回 全国大会《福岡大会》
１０/１１〜１０/１２
＜大会テーマ＞：音楽と心
●2001年（平成13年）第17回 全国大会《関東大会》
９/６〜９/８
＜大会テーマ＞：保育者養成校の担うべき役割と課題・ー音楽教育の視点からー
●2000年（平成12年）第16回 米子大会
９/１０〜９/１２
＜大会テーマ＞：新しい幼稚園教育要領・保育指針が実践できる（音楽の視点から）保育者養成をめざして
●1999年（平成11年）第15回 京都大会
９/１〜９/３
＜大会テーマ＞：２１世紀を拓く教員・保育者養成・ー遊びの音楽ー
●1998年（平成10年）第14回 札幌大会
９/２〜９/４
＜大会テーマ＞：福祉社会に対応する音楽活用の可能性を求めて
●1997年（平成９年）第13回 山形大会
（遊学館）９/４〜９/５
＜大会テーマ＞：保育者養成の今日の課題と２１世紀への助走
ー領域・表現につながる音楽教育を考えるー
●1996年（平成８年）第12回 名古屋大会
（名古屋ガーデンパレス・ヤマハホール）９/５〜９/６
＜大会テーマ＞：２１世紀の保育者養成を探る・ー音楽教育を通してー
●1995年（平成７年）第11回 鹿児島大会
（鹿児島サンロイヤルホテル）６/１６〜６/１７
＜大会テーマ＞：よりよき保育者養成をめざして
ー今保育者にどのような音楽的能力が求められているかー
●1994年（平成６年）第10回 東京大会
（音楽之友社ホール・東京ガーデンパレス）１０/２１〜１０/２２
＜大会テーマ＞：音楽教育の原点について
●1993年（平成５年）第9回 岡山大会
（岡山国際ホテル）１０/２１〜１０/２２
＜大会テーマ＞：保育者養成における音楽教材について・ー基礎技能の育成と教材ー
●1992年（平成４年）第8回 札幌大会
（札幌ガーデンパレス）９/３〜９/４
＜大会テーマ＞：保育者養成における音楽教育の基礎とは何か
ーその指導内容と指導方法の原点をさぐるー
●1991年（平成３年）第7回 大阪大会
（大阪ガーデンパレス）１０/８〜１０/９
＜大会テーマ＞：幼児教育者の音楽的資質向上をめざして
ー基礎能力と応用力を体得させるために
●1990年（平成２年）第6回山形大会
（蔵王アストリアホテル）１０/１２〜１０/１３
＜大会テーマ＞：保育学生の音楽力を向上させる具体的方法を模索する
ー現場の期待する音楽力の研究をふまえてー
●1989年（平成元年）第5回 名古屋大会
（松下視聴覚教育財団・名古屋AVセンター）１１/１０〜１１/１１
＜大会テーマ＞：子どものためのソルフェージュ及び発声、歌唱
●1988年（昭和3年）第4回 熊本大会
（熊本短期大学）９/９〜９/10
＜大会テーマ＞：よりよき保育者養成をめざして・ー音楽面からのアプローチー
●1987年（昭和62年）第3回 全国大会
（和泉短期大学）１１/１０
＜大会テーマ＞：音楽リズムと小児体育（リトミック）
●1986年（昭和61年）第2回 全国大会
（松山東雲短期大学）１１/１
＜大会テーマ＞：音楽性豊かな保育者養成をめざして
●1985年（昭和60年）第1回 全国大会
（四條畷学園女子短期大学）６/１９
＜大会テーマ＞：子どものためのソルフェージュ及び発声、歌唱